Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
POLR2J2Q9GZM3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2J2Q9GZM3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms