Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNTNAP4Q9C0A0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms