Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC13A1Q9BZW2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms