Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms