Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
YTHDF1Q9BYJ9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
YTHDF1Q9BYJ9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms