Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KDM5DQ9BY66 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5DQ9BY66 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms