Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC94Q9BW85 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC94Q9BW85 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms