Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDC1Q9BTX1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NDC1Q9BTX1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms