Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NICN1Q9BSH3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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