Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF1Q9BQI6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF1Q9BQI6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms