Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TREX2Q9BQ50 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms