Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPAS2Q99743 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPAS2Q99743 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms