Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL13Q99616 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms