Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED4Q96RK1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms