Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms