Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSSK3Q96PN8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms