Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL15Q96M94 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL15Q96M94 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL15Q96M94 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms