Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC7Q96M83 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC7Q96M83 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms