Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NEURL4Q96JN8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms