Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRIQ1Q96JM4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRIQ1Q96JM4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
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