Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5RAP3Q96JB5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms