Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG3Q96JB2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms