Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRIG1Q96JA1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms