Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TPD52L3Q96J77 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms