Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED3Q96IU2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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