Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIN37Q96GY3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms