Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RNFT2Q96EX2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms