Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPDL1Q96EA4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPDL1Q96EA4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPDL1Q96EA4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPDL1Q96EA4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPDL1Q96EA4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPDL1Q96EA4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms