Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHMP4CQ96CF2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4CQ96CF2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms