Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RUNDC1Q96C34 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUNDC1Q96C34 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms