Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEIL2Q969S2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms