Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF25Q93038 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms