Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNPO1Q92973 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNPO1Q92973 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms