Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC4Q8WW27 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC4Q8WW27 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms