Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD1Q8NA66 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms