Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNLDC1Q8NA58 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms