Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MSL3Q8N5Y2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSL3Q8N5Y2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms