Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2BQ8N4Y2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms