Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMTC2Q8N394 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMTC2Q8N394 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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