Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC2Q8N158 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms