Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM1

SEPT12, Septin-12, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT12Q8IYM1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEPT12Q8IYM1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT12Q8IYM1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT12Q8IYM1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT12Q8IYM1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT12Q8IYM1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT12Q8IYM1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT12Q8IYM1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms