Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC84Q86UT8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC84Q86UT8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms