Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG4DQ86TL0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms