Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMC4Q7Z404 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms