Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRRC9Q6ZRR7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms