Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DPPA3Q6W0C5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms