Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC137Q6PK04 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC137Q6PK04 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms