Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEF6Q5VXH4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms