Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf135Q5VTT2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms