Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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FAM78BQ5VT40 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM78BQ5VT40 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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